Estudio de la Respuesta Génica in Silico al Estrés Hídrico en Pennisetum glaucum
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Data
2021
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Resumo
Las literaturas revisadas ubican a P. glaucum como un cereal caracterizado por su calidad
nutritiva y alta tolerancia al estrés por sequía. Sin embargo, es muy poco el conocimiento
que se tiene sobre el mecanismo molecular que utiliza en respuesta al estrés hídrico.
Para intentar esclarecer este punto realizamos un análisis de la modulación de la expresión de 2 tipos diferentes de genes a) PgVDAC, que codifica una proteína de voltaje de canal dependiente de aniones, como representante de genes estructurales y b) a la familia FT bZIP, como representante de genes reguladores por su baja exploración como candidatos potenciales para tolerancia al estrés hídrico. El hallazgo in silico de múltiples elementos ABREs, MYC, MYB-MBS y DRE en la región promotora de PgVDAC, sugieren
su doble participación en el estrés hídrico, tanto en la vía dependiente como la vía independiente de ABA. Un cribado por todo el genoma de P. glaucum lanzó 52 probables FT bZIP, de los cuales 9 se mostraron diferencialmente expresos bajo condiciones de estrés hídrico, filtrados de datos de RNA-seq de un Transcriptoma depositado en el NCBI. Las regiones promotoras de estos genes bZIP presentaban múltiples elementos o
motivos cis ABREs y DRE sugiriéndose así a su doble participación modulada en la respuesta lenta o adaptativa y en la respuesta rápida de este cereal al estrés hídrico. Los hallazgos de este estudio aportan datos complementarios para la comprensión del mecanismo detrás de la adaptación de P. glaucum bajo el estrés hídrico, pudiendo ser relevante para aplicaciones moleculares de cultivos potenciales.
Abstract
Descrição
Dissertação de mestrado apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Biociências, do Instituto Latino-Americano de Ciências da Vida e da Natureza, da Universidade Federal da Integração Latino-Americana, como requisito parcial à obtenção do título de Mestre em Ciências, área de concentração Biociências.
Palavras-chave
P. glaucum, estrés hídrico, PgVDAC, elementos cis, FT PgBZIP