Identificação de fungos filamentosos isolados: avanços, desafios taxonômicos e sua relevância biotecnológica
| dc.contributor.author | Fagundes, Luiz Fernando Grandi | |
| dc.date.accessioned | 2025-03-26T11:17:28Z | |
| dc.date.available | 2025-03-26T11:17:28Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.description | Trabalho de Conclusão de Curso apresentado ao Instituto Latino-Americano de Ciências da Vida e da Natureza da Universidade Federal da Integração Latino-Americana, como requisito parcial à obtenção do título de Bacharel em Biotecnologia. | |
| dc.description.abstract | Devido às suas particularidades, os fungos ao longo do tempo apresentaram diversos dilemas em relação a sua identificação, desde sua própria sistemática até as abordagens utilizadas. Com algumas inovações biotecnológicas recentes, principalmente as moleculares, como a reação em cadeia da polimerase (PCR), metagenômica e análises filogenéticas, surgiram soluções, mas também problemas à micologia. A relação entre fungos e biotecnologia é forte, pois estes apresentam alto potencial biotecnológico em diversos âmbitos, bem como a biotecnologia apresenta alto potencial de avanços à micologia. Através de uma metodologia de análise cienciométrica, baseada no protocolo PRISMA, almejou-se observar os padrões, tendências e lacunas presentes na identificação de fungos filamentosos isolados e analisar qual o papel que a biotecnologia exerceu e pode exercer neste campo de pesquisa. A coleta amostral na base de dados Web Of Science resultou em 2.094 registros, os quais foram triados com o auxílio da plataforma RAYYAN utilizando critérios bem definidos de exclusão, resultando em 534 artigos que pertenciam ao escopo do trabalho. Dentro deste grupo amostral foram identificadas seis abordagens de identificação bem definidas (química, imunológica, molecular, morfológica, fisiológica e proteômica) e uma refletindo abordagens indefinidas. As áreas de pesquisa foram determinadas baseando-se nas informações disponíveis dos artigos e foram observadas sete áreas principais: agropecuária, biotecnologia, cultural, ambiental, saúde, industrial e taxonomia. Foi analisada a distribuição dos artigos ao longo do tempo e os eventos de acréscimo e declínio apresentaram possíveis explicações por acontecimentos históricos dentro da taxonomia fúngica. Entre as abordagens, identificou-se uma possível emergência com a abordagem química, uma ampla adesão da molecular, persistência da morfológica, escassez da fisiológica e possível estabelecimento da proteômica. Das áreas, foi identificada grande quantidade de artigos sendo contemplados pela área da saúde (304), uma quantidade razoável e similar (~121) para biotecnologia, ambiental e agropecuária, e poucos artigos (>70) para as áreas de taxonomia, industrial e cultural. Um ponto a se destacar é a baixa quantidade de artigos da área biotecnologia que que utilizaram a abordagem proteômica, uma análise baseada em conhecimentos biotecnológicos. Atentando-se à demanda taxonômica atual sobre a identificação de fungos por abordagens polifásicas, concluiu-se que esta é um alvo estratégico à biotecnologia, pois impulsiona avanços em bioinformática e inteligência artificial, ampliando as aplicações biotecnológicas. Resumen Durante las últimas décadas, debido a sus particularidades, los hongos han presentado algunos dilemas en su identificación, desde su propia sistemática hasta por los abordajes utilizados. Con algunas innovaciones biotecnológicas recientes, principalmente moleculares, cómo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), metagenómica y análisis filogenéticos, surgieron soluciones, pero también nuevos problemas para la micología. A través de una metodología de análisis cienciométrico, basado en el protocolo PRISMA, se aspiró a reconocer patrones, tendencias y carencias presentes en la identificación de hongos y el papel que la biotecnología ejerció y puede ejercer en este campo. La muestra se colectó desde la base de documentos bibliográficos Web Of Science, que resultó en 2.094 registros, los cuales fueron categorizados con asistencia de la plataforma RAYYAN, utilizando criterios de exclusión definidos, resultando en la obtención de 534 artículos que pertenecen al objetivo de este trabajo. Desde esa muestra fueron identificadas seis abordajes de identificación bien definidas (química, inmunológica, molecular, morfológica, fisiológica y proteómica) y una tipificando abordajes imprecisos. Las áreas de investigación fueron definidas basándose en las informaciones disponibles de los artículos y fueron, identificadas principalmente siete: agropecuaria, biotecnología, cultural, ambiental, salud, industrial y taxonomía. Se analizó la distribución de los artículos a lo largo del tiempo, y el aumento y disminución de la producción bibliográfica tuvieron posibles explicaciones debido a la historia de la taxonomía de los hongos. Sobre los abordajes, se observó una posible emergencia del abordaje químico, un amplio uso de la molecular, persistencia de la morfológica, escasez de la fisiológica y posible establecimiento de la proteómica. En cuanto a las áreas, se observó una gran cantidad de artículos contemplados por el área de la salud (304), una cantidad considerable y similar (~121) para biotecnología, ambiental y agropecuaria, y una menor cantidad (>70) para taxonomía, industrial y cultural. Un punto a destacar es la baja cantidad de artículos de la área biotecnología que utilizan el abordaje proteómica, un análisis basado en conocimientos biotecnológicos. Considerando la creciente demanda taxonómica actual para la identificación de hongos por abordajes polifásicas, se concluyó que esta representa un objetivo estratégico para la biotecnología, ya que impulsa avances em bioinformática e inteligencia artificial, ampliando las aplicaciones biotecnológicas. | |
| dc.identifier.uri | https://dspace.unila.edu.br/handle/123456789/8969 | |
| dc.language.iso | vi | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | biodiversidade | |
| dc.subject | Micologia | |
| dc.subject | fungos | |
| dc.subject | Biotecnologia | |
| dc.title | Identificação de fungos filamentosos isolados: avanços, desafios taxonômicos e sua relevância biotecnológica | |
| dcterms.abstract | Due to fungi’s unique set of characteristics, they have historically presented various challenges regarding their identification, from issues in their systematics to the approaches employed. Recent biotechnological innovations, particularly molecular techniques, such as polymerase chain reaction (PCR), metagenomics, and phylogenetic analyses, have introduced solutions, but also new challenges to mycology. The link between fungi and biotechnology is strong, as fungi exhibit high biotechnological potential across various fields, while biotechnology holds significant potential for advancements in mycology. Utilizing a scientometric analysis methodology, based on PRISMA recommendation, this study aims to observe patterns, trends, and gaps in fungal identification and explore the role biotechnology has played and could play in this research field. The data collected from the database WOS resulted in 2.094 records, which were screened in the software RAYYAN applying well defined exclusion criteria, resulting in 534 articles within the study’s scope. Within this sample, sex well-defined fungal identification approaches were identified (chemical, immunological, molecular, morphological, physiological, and proteomic), along with one category reflecting undefined approaches. The research areas were classified based on the available article information, resulting in seven main areas: agro, biotechnology, culture, environment, health, industry and taxonomy. The articles’ temporal distribution was analyzed, revealing patterns of increase and decline that could be explained by historical fungal taxonomy events. Among the approaches, was observed the possible chemical approach emergence, along with widespread molecular adoption, morphological’s persistence, physiological’s lackness, and a potential proteomic establishment. Regarding the areas, health accounted for the largest number of studies (304), followed by considerable and similar numbers (~121) in biotechnology, environment and agriculture, while taxonomy, industrial applications, and cultural studies had lower representation (>70 articles). A noteworthy aspect is the limited number of articles in the field of biotechnology that employed the proteomic approach, an analysis based on biotechnological knowledge. Given the increasing taxonomic demand for fungal identification through polyphasic approaches, it was concluded that this represents a strategic target for biotechnology, as it drives advances in bioinformatics and artificial intelligence, expanding biotechnological applications. |
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